При Канцелярии был создан специальный орган (Комиссарское правление)

Местным органом управления комплексом была Канцелярия Колывано-Воскресенского горного начальства, созданная указом 1 мая 1747 г. Она делилась на присутствие (собственно горное начальство) и штат канцелярских служителей (канцелярию).

В 1748 г. в общее присутствие Канцелярии горного начальства входили: начальник заводов генерал-майор А. В. Беэр, его заместитель асессор А. И. Порошин, управляющий Колывано-Воскресенским заводом асессор И. Г. Улих и управляющий Барнаульским заводом асессор И. С. Христиани. Таким образом, горное начальство должно было воплощать главный принцип петровских преобразований - коллегиальность управления.

При Канцелярии был создан специальный орган (Комиссарское правление), который ведал учетом всех припасов, материалов и инструментов, денежных средств, оплатой труда мастеровых и работных, а также закупками необходимых материалов и оборудования [12, л. 3-4 об.]. Он находился в непосредственном подчинении горного начальства и располагался в поселке Барнаульского завода. Во главе Комиссарского правления находился горный офицер, назначаемый на 1-2 года.