Реформа гражданской системы управления обусловила существенное изменение системы управления

Обычно в наместничество входило несколько губерний.

В 1783 г. было создано Колыванское наместничество, в которое вошла одна губерния — Колыванская. Первым генерал-губернатором стал генерал-поручик И. В. Якоби, который также «правил должность генерал-губернатора» Иркутского наместничества. Торжественное открытие Колыванской губернии состоялось 28 июля 1783 г. в присутствии Якоби [43, с. 1029]. Несмотря на то, что центром губернии и наместничества был назначен Бердск, все губернские и наместнические учреждения разместились в поселке Барнаульского завода. Завод был также местом пребывания правителя губернии Б. Меллера. И. Якоби избрал своей резиденцией город Иркутск.

Таким образом, на карте Западной Сибири появились следующие административные единицы: Тобольское наместничество в составе Тобольской и Томской губерний; Колыванское наместничество, границы которого совпадали с Колыванской губернией.

Реформа гражданской системы управления обусловила существенное изменение системы управления Колывано-Воскресенскими заводами. Должность руководителя предприятиями вместо «главного командира» теперь называлась «начальник заводов». Начальником заводов в сентябре 1779 г. был назначен Борис Меллер, который теперь совмещал эту должность с обязанностями правителя Колыванской области [15, л. 10-17; 17, л. 13]. В силу этого он подчинялся двум центральным учреждениям: Сенату и императорскому Кабинету.